| 名次 | 学校名称 | 所在地区 | 2015年世界排名 | 2016排名情况 | |||
| 平均位次 | 次数 | 全国排名 | 星级排名 | 办学层次 | |||
| 1 | 北京大学 | 北京 | 41 | 3 | 1 | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 2 | 清华大学 | 北京 | 44 | 3 | 2 | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 3 | 香港大学 | 香港 | 46 | 3 | - | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 4 | 香港科技大学 | 香港 | 76 | 3 | - | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 5 | 香港中文大学 | 香港 | 103 | 3 | - | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 6 | 复旦大学 | 上海 | 116 | 3 | 3 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 7 | 台湾大学 | 台湾 | 122 | 3 | - | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 8 | 香港城市大学 | 香港 | 148 | 3 | - | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 8 | 中国科学技术大学 | 安徽 | 148 | 3 | 12 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 10 | 浙江大学 | 浙江 | 156 | 3 | 5 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 11 | 上海交通大学 | 上海 | 169 | 3 | 7 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 12 | 香港理工大学 | 香港 | 178 | 3 | - | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 13 | 南京大学 | 江苏 | 187 | 3 | 8 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 14 | 台湾清华大学 | 台湾 | 236 | 3 | - | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 15 | 中山大学 | 广东 | 285 | 3 | 10 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 16 | 台湾交通大学 | 台湾 | 306 | 3 | - | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 17 | 武汉大学 | 湖北 | 308 | 3 | 4 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 18 | 台湾成功大学 | 台湾 | 341 | 3 | - | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 19 | 厦门大学 | 福建 | 359 | 3 | 23 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 20 | 北京师范大学 | 北京 | 264 | 2 | 15 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 21 | 台湾科技大学 | 台湾 | 281 | 2 | - | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 22 | 南开大学 | 天津 | 288 | 2 | 16 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 23 | 哈尔滨工业大学 | 黑龙江 | 305 | 2 | 21 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 24 | 香港浸会大学 | 香港 | 316 | 2 | - | 3星级 | 中国知名大学 |
| 25 | 西安交通大学 | 陕西 | 334 | 2 | 17 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 26 | 同济大学 | 上海 | 340 | 2 | 19 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 27 | 华中科技大学 | 湖北 | 353 | 2 | 13 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 28 | 台湾阳明大学 | 台湾 | 370 | 2 | - | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 29 | 吉林大学 | 吉林 | 399 | 2 | 11 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 30 | 东南大学 | 江苏 | 410 | 2 | 24 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 31 | 台湾中央大学 | 台湾 | 412 | 2 | - | 5星级 | 中国一流大学 |
| 32 | 华东理工大学 | 上海 | 436 | 2 | 48 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 33 | 北京理工大学 | 北京 | 439 | 2 | 30 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 33 | 天津大学 | 天津 | 439 | 2 | 20 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 35 | 四川大学 | 四川 | 468 | 2 | 14 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 36 | 山东大学 | 山东 | 272 | 1 | 21 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 37 | 大连理工大学 | 辽宁 | 375 | 1 | 29 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 38 | 台湾师范大学 | 台湾 | 376 | 1 | - | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 39 | 台湾中山大学 | 台湾 | 379 | 1 | - | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 40 | 北京航空航天大学 | 北京 | 381 | 1 | 25 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 41 | 中国农业大学 | 北京 | 381 | 1 | 32 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 42 | 华南理工大学 | 广东 | 395 | 1 | 31 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 43 | 澳门大学 | 澳门 | 401 | 1 | - | 5星级 | 中国一流大学 |
| 43 | 台湾中国医药大学 | 台湾 | 401 | 1 | - | 3星级 | 中国知名大学 |
| 45 | 华东师范大学 | 上海 | 407 | 1 | 28 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 46 | 上海大学 | 上海 | 411 | 1 | 75 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 47 | 台北医学大学 | 台湾 | 421 | 1 | - | 3星级 | 中国知名大学 |
| 48 | 中南大学 | 湖南 | 440 | 1 | 18 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 49 | 中国人民大学 | 北京 | 441 | 1 | 6 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 50 | 兰州大学 | 甘肃 | 447 | 1 | 36 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 51 | 台湾长庚大学 | 台湾 | 461 | 1 | - | 5星级 | 中国一流大学 |
| 52 | 江南大学 | 江苏 | 491 | 1 | 99 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 53 | 中国地质大学 | 湖北 | 494 | 1 | 39 | 5星级 | 中国一流大学 |
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