一、调剂有风险
合并院校最大的弊端就是关于调剂。经过合并后的高校虽然学科门类很丰富，但偏门专业和不相关专业也会随之增多，无疑这些专业就是我们在调剂时所面临的最大隐患。如果是为上名校而选择读研，选择服从调剂的同时在专业方向上就会有更大的风险和未知。反之一些没有合并过的院校看似规模没有那么大，实力可能也不能算最好的，但是因为没有进行过合并，这些院校就保留了它原有的强项专业，偏门专业和不相关的专业相对也比较少，在调剂的时候也许会给你带来意想不到运势。
二、排名以偏盖全
对于院校的选择，大多数家长和考生都尊崇越有名越好的态度，盲目轻信高校排名，这也无可厚非。但问题是在这种错误引导之下，我们往往会过于关注院校的整体名气而忽略专业实力，而合并院校中的一些弱势专业就很容易“蒙混过关”，很多学生都是考上了才发现这个问题，但却“悔之晚矣”。所以对于院校的排名，可以作为选择院校的参考，但不可盲从。在院校的选择上，应该根据自己所学专业，个人水平，家庭情况和期望值等综合客观的进行考虑。
三、师资力量影响教学质量
一些院校经过合并后会进行扩招，研究生录取人数越来越多，但是目前高校的研究生导师数量增长率远远低于研究生增长率。院校的师资力量已大不如前。学生无法得到导师的全力指导，读研也就很容易失去方向。所以在做选择的时候，也应该多多关注院校的导师资源和教学情况。
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