| 名次 | 学校名称 | 所在地区 | 总分 | 2016办学类型、等级和层次 | ||
| 办学类型 | 星级排名 | 办学层次 | ||||
| 1 | 北京大学 | 北京 | 100.00 | 中国研究型 | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 2 | 清华大学 | 北京 | 98.50 | 中国研究型 | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 3 | 复旦大学 | 上海 | 82.79 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 4 | 武汉大学 | 湖北 | 82.43 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 5 | 浙江大学 | 浙江 | 82.38 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 6 | 中国人民大学 | 北京 | 81.98 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 7 | 上海交通大学 | 上海 | 81.76 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 8 | 南京大学 | 江苏 | 80.43 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 9 | 国防科学技术大学 | 湖南 | 80.31 | 中国研究型 | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 10 | 中山大学 | 广东 | 76.46 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 11 | 吉林大学 | 吉林 | 76.01 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 12 | 中国科学技术大学 | 安徽 | 75.14 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 13 | 华中科技大学 | 湖北 | 75.12 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 14 | 四川大学 | 四川 | 74.99 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 15 | 北京师范大学 | 北京 | 74.75 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 16 | 南开大学 | 天津 | 74.46 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 17 | 西安交通大学 | 陕西 | 73.56 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 18 | 中南大学 | 湖南 | 73.13 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 19 | 同济大学 | 上海 | 72.85 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 20 | 天津大学 | 天津 | 72.81 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
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